Secara geografis wilayah Pemerintahan Kelurahan Kidul Dalem yang berpusat di Jl. MGR. Sugiyo Pranoto No. 23 A Kecamatan Klojen terletak di jantung kota dan pusat pemerintahan Kota Malang, yang secara astronomis berada pada koordinat 112,06° – 112,07° Bujur Timur dan 7,06° – 8,02° Lintang Selatan. Luas wilayah Kelurahan Kidul Dalem adalah 0,49 km2 dan sebagian besar merupakan daratan aluvial dengan ketinggian antara 440 – 667 meter di atas permukaan air laut. Seperti halnya daerah lain di Kota Malang maupun Indonesia pada umumnya, wilayah Kelurahan Kidul Dalem juga mengalami perputaran 2 iklim; iklim hujan dan kemarau. Curah hujan yang relatif tinggi terjadi pada bulan Pebruari, Nopember, Desember dan pada bulan Juni dan September Curah hujan relatif rendah. Adapun rata-rata suhu udara berkisar antara 23°C hingga 27°C. Suhu tertinggi mencapai 34,2°C dan suhu terendah 18,4°C. Rata-rata kelembaban udara antara 79% sampai 86%, dengan kelembaban maksimum 99% dan kelembaban minimum mencapai 40%.
Kelurahan Kidul Dalem memiliki batas-batas wilayah sebagai berikut: a) sebelah utara berbatasan dengan wilayah Kel. Klojen, b) sebelah timur wilayah Kel. Ksatrian dan Kel. Jodipan, c) sebelah barat wilayah Kel. Kauman, dan c) wilayah selatan wilayah Kel. Sukoharjo. Di bagian tengah wilayah Kelurahan Kidul Dalem mengalir Sungai Brantas yang membelah sepanjang 2 km dari timur ke barat, melintasi 7 RW dari 8 RW yang ada. Keberadaan sungai tersebut mempengaruhi topografi di daerah sekitar sungai yang memiliki lebar 6 hingga 10 meter tersebut hingga menjadi lebih landai.